Die Organisation als Ganztagsschule bietet der Oberschule Salzhausen die Möglichkeit die Eigenverantwortung der Schülerinnen und Schüler zu stärken, ein vielfältiges Angebot an Projektarbeit vorzuhalten und demokratische Prinzipien von Anbeginn an zu fördern.
Dies findet im Lernatelier, in der EVA-Zeit, im Klassenrat und der Eingangsphase statt. Die Teilnahme an Arbeitsgemeinschaften ist freiwillig.